Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tlr5Q9JLF7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr5Q9JLF7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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