Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SacsQ9JLC8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms