Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hip1rQ9JKY5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hip1rQ9JKY5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms