Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot9Q9JKY0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot9Q9JKY0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms