Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3aQ9JKX8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms