Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
AatfQ9JKX4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AatfQ9JKX4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms