Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scamp4Q9JKV5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms