Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Habp4Q9JKS5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Habp4Q9JKS5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms