Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmod2Q9JKK7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Tmod2Q9JKK7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Tmod2Q9JKK7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmod2Q9JKK7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms