Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nectin1Q9JKF6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nectin1Q9JKF6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nectin1Q9JKF6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nectin1Q9JKF6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nectin1Q9JKF6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin1Q9JKF6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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