Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms