Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssna1Q9JJ94 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms