Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip2Q9JHR9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrip2Q9JHR9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms