Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13bQ9ET35 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13bQ9ET35 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13bQ9ET35 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13bQ9ET35 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13bQ9ET35 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tnfrsf13bQ9ET35 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfrsf13bQ9ET35 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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