Protein–RNA interactions for Protein: Q9EST1

Gsdma, Gasdermin-A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmaQ9EST1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GsdmaQ9EST1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms