Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ParvbQ9ES46 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ParvbQ9ES46 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms