Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms