Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tfip11Q9ERA6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfip11Q9ERA6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfip11Q9ERA6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfip11Q9ERA6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfip11Q9ERA6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfip11Q9ERA6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tfip11Q9ERA6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms