Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms