Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ndst3Q9EQH7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndst3Q9EQH7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms