Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cxcr6Q9EQ16 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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