Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hmgn3Q9DCB1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms