Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf1Q9DBU0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms