Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms