Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Swt1Q9DBQ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms