Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tysnd1Q9DBA6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tysnd1Q9DBA6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms