Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smg9Q9DB90 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smg9Q9DB90 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms