Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb1Q9DAK3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb1Q9DAK3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb1Q9DAK3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb1Q9DAK3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb1Q9DAK3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhobtb1Q9DAK3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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