Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DA42 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DA42 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DA42 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DA42 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9DA42 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9DA42 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9DA42 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms