Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sgf29Q9DA08 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms