Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actrt1Q9D9J3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms