Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx5Q9D8U8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms