Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc91Q9D8L5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms