Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl4Q9D8E6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl4Q9D8E6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms