Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U2af1Q9D883 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
U2af1Q9D883 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms