Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh2d4aQ9D7V1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms