Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl40Q9D783 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms