Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Borcs6Q9D6W8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Borcs6Q9D6W8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Borcs6Q9D6W8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Borcs6Q9D6W8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Borcs6Q9D6W8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Borcs6Q9D6W8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs6Q9D6W8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs6Q9D6W8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms