Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm5Q9D6G9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm5Q9D6G9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms