Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PudpQ9D5U5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PudpQ9D5U5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PudpQ9D5U5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PudpQ9D5U5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PudpQ9D5U5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PudpQ9D5U5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PudpQ9D5U5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PudpQ9D5U5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PudpQ9D5U5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PudpQ9D5U5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PudpQ9D5U5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PudpQ9D5U5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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