Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3a3Q9D554 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a3Q9D554 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms