Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms