Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phf6Q9D4J7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf6Q9D4J7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms