Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms