Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfap53Q9D439 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms