Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933421I07RikQ9D420 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms