Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933428M09RikQ9D3X3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933428M09RikQ9D3X3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms