Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx29Q9D3S3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms