Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rufy3Q9D394 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms