Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx20Q9D2Y5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms